Warna sarung batik Pekalongan adalah warna yang natural, seperti coklat atau merah bata. Berbeda dengan warna batik Pekalongan sekarang karena lebih dinamis, dan lebih beragam warnanya seperti cerah atau biasanya orang menamainya gejreng. Sarung batik Pekalongan yang memiliki warna cerah itu hampir mirip dengan sarung batik Cirebon yang juga sering berwarna cerah. Beberapa hari dari sarung batik Pekalongan memiliki ciri khas yang mirip dengan Eropa.