UK Petra membuka Magister Teknik Industri. Konsentrasi program yang ditawarkan adalah Rekayasa Sistem Industri dan Rekayasa Sistem Informasi Industri. Biaya perkuliahan total selama 4 semester sebesar Rp 40.000.000 dan dapat diangsut dalam 4 semester. Biaya matrikulasi Rp 750.000 per mata kuliah untuk maksimal 4 mata kuliah.